Ich werde deine bulk rnaseq Daten mit publikationsfertigen Abbildungen analysieren

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Bioinformatik-Spezialist Datenwissenschaftler

PhD-Bioinformatik-Spezialist mit 8 Jahren Erfahrung in der Durchführung genomischer Analysen und automatisierter Pipelines für klinische Diagnostik und akademische Forschung. Ich helfe Forschern und B...

Über diesen Service

Hast du Schwierigkeiten bei der RNA-seq-Analyse? Ich verwandle deine Rohdaten in Ergebnisse, die für die Veröffentlichung bereit sind.

WAS DU BEKOMMST:

Qualitätskontrollberichte (FastQC, MultiQC)

Differenzielle Expressionsanalyse (DESeq2 oder edgeR)

Vulkangrafik mit hoch- und runterregulierten Genen

PCA-Diagramm mit Stichprobengruppierung

Heatmap der top differentially expressed genes

GO/KEGG-Pfad-Analyse

CSV-Dateien mit allen Statistiken und Genlisten

Verfasster Methodenabschnitt (bereit für dein Paper)

WAS ICH VON DIR BRAUCHE:

- FASTQ-Dateien (oder SRA-Accession-Nummern)

- Stichprobeninformationen (welche Proben Kontrolle vs. Behandlung)

- Organismenname (ich kann mit jeder Spezies mit Transkriptom arbeiten)

Ich verwende branchenübliche Tools: Salmon/STAR für die Ausrichtung, DESeq2/edgeR für Statistiken, clusterProfiler für die Pfadanalyse. Alle Analysen sind vollständig reproduzierbar mit dokumentiertem Code.

ERFAHRUNG: Multi-Gewebe-RNA-seq (Gehirn, Leber, Niere, Hoden, Fett) Zeitreihen-Experimente (Photoperiodenreaktion) Daten mit niedriger Abdeckung und seltenen Transkripten Klinische Variantenbestimmung aus RNA-seq Nicht-Modell-Organismen ohne Annotation.

Fragen? Schreib mir vor der Bestellung. Ich bespreche gern deine spezifischen Bedürfnisse und empfehle das passende Paket!