Ich analysiere deine DNA-Methylierung und Epigenetik-Daten

Ich analysiere Epigenetik-Daten: DNA-Methylierung (Arrays oder Bisulfit-/Enzymsequenzierung), ChIP-seq und ATAC-seq und verwandle sie in Ergebnisse, die du interpretieren und in einer Arbeit verwenden kannst.

Für Methylierungsdaten arbeite ich sowohl mit arraybasierten Daten (Illumina 450k/EPIC) als auch mit sequenzbasierten Daten (WGBS, RRBS, EM-seq), da sich die Analyseansätze zwischen beiden deutlich unterscheiden. Ich sage dir, welche Methode für deinen Datentyp relevant ist. Das umfasst in der Regel Qualitätskontrolle, Normalisierung, differentiell methylierte Regionen zwischen Gruppen und die Annotation bedeutender Regionen zu Genen oder genomischen Merkmalen.

Für ChIP-seq und ATAC-seq umfasst der Workflow die Ausrichtung der Reads, Peak-Calling und die Analyse der differentiellen Zugänglichkeit oder Bindung, inklusive Visualisierung der Signalspuren und Peak-Annotation.

In allen Fällen soll das Ergebnis interpretierbar sein: klare Diagramme, eine Zusammenfassung darüber, worauf die signifikanten Regionen oder Peaks biologisch tatsächlich hinweisen, und ausreichend Dokumentation der Methode, sodass sie direkt in den Methodenteil übernommen werden kann.

Schreib mir vor der Bestellung mit deinem Datentyp und Studiendesign, damit ich den Umfang bestätigen und dir ein genaues Angebot machen kann.