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Ich werde Single Cell RNA-Seq Transkriptomik und Multiomics analysieren
Bioinformatik, Wissenschaftliches Schreiben und Datenanalyse
Ich bin Biologe und Doktorand mit Erfahrung in Molekularbiologie, Bioinformatik, Datenanalyse, biotechnologischer Forschung und Entwicklung, wissenschaftlichem Schreiben und Forschungsunterstützung. I...
Über diesen Service
Ich unterstütze Forscher, Studierende und Biotech-Teams dabei, Transkriptomik, Single-Cell RNA-Seq und Multi-Omics-Daten mit klaren, reproduzierbaren und biologisch bedeutungsvollen Ergebnissen zu analysieren.
Ich kann mit Bulk RNA-Seq, Single-Cell RNA-Seq, Genexpressionsmatrizen, GEO-Datensätzen, verarbeiteten Proteomik-Tabellen und anderen biologischen Datensätzen arbeiten, die Differenzialexpression, Clustering, Marker-Gene, Pfadweg-Enrichment oder Biomarker-Entdeckung erfordern.
Je nach Projekt kann ich QC-Zusammenfassungen, PCA, UMAP, Clustering, Volcano-Plots, Heatmaps, Differenzialexpressionsanalysen, GO/KEGG-Enrichment, Kandidatengene, biologische Interpretation, reproduzierbaren R/Python-Code und einen strukturierten Bericht bereitstellen.
Mein Hintergrund als Biologe und Doktorand ermöglicht es mir, die computergestützten Ergebnisse mit echtem biologischem Kontext zu verbinden, nicht nur Plots oder Tabellen zu liefern.
Für Roh-FASTQ-Dateien, große Single-Cell-Datensätze oder komplexe Multi-Omics-Projekte kontaktiere mich bitte vor der Bestellung, damit ich den Datentyp, das experimentelle Design und die Machbarkeit prüfen kann.
Domäne:
Andere
Expertise:
Andere
Programmiersprache:
Python
•
R
Tools:
Andere
Technologie:
Python
•
R
•
Jupyter-Notizbuch
•
RStudio
Modelle & Methoden:
Andere
Meine weiteren Dienstleistungen im Bereich Datenwissenschaft & ML
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Art von Omics-Daten kannst du analysieren?
Ich kann mit Bulk RNA-Seq, Single-Cell RNA-Seq, Genexpressionsmatrizen, GEO-Datensätzen, verarbeiteten Proteomik-Tabellen und anderen biologischen Datensätzen arbeiten, abhängig vom Format und Ziel.
Analysierst du Roh-FASTQ-Dateien?
Roh-FASTQ-Analysen sind nur nach Absprache möglich, da sie von Dateigröße, Anzahl der Proben, QC-Bedarf und dem benötigten Pipeline abhängen. Bitte kontaktiere mich zuerst.
Kannst du öffentliche Datensätze von GEO verwenden?
Ja. Ich kann bei der Analyse öffentlicher Datensätze von GEO oder ähnlichen Repositories helfen, wenn die Daten verfügbar, gut annotiert und für die angeforderte Analyse geeignet sind.
Analysierst du Single-Cell RNA-Seq Daten?
Ja. Ich kann mit Single-Cell RNA-Seq Daten unter Verwendung von Seurat oder Scanpy arbeiten, inklusive QC, Clustering, UMAP, Marker-Gene und biologischer Interpretation.
Kannst du Proteomik-Daten analysieren?
Ja, wenn du verarbeitete Protein-Absenz-Tabellen, LFQ-Intensitätstabellen oder normalisierte Proteomik-Ergebnisse bereitstellst. Roh-Massenspektrometrie-Dateien sind kein Standardpaket.
Kannst du signifikante Gene oder Biomarker garantieren?
Nein. Ergebnisse hängen von Stichprobengröße, Datenqualität, experimentellem Design und biologischem Signal ab. Ich biete eine rigorose Analyse, kann aber keine spezifischen Ergebnisse garantieren.
Was brauchen Sie zum Starten?
Ich benötige dein Dataset, Metadaten oder Probeninformationen, Gruppenzuweisungen, Forschungsfragen, erwartete Ergebnisse und alle bevorzugten Tools oder Formate.
Stellen Sie Code bereit?
Ja. Je nach Paket kann ich reproduzierbaren R- oder Python-Code, Skripte oder ein Notebook mit dem Analyse-Workflow bereitstellen.
Soll ich Sie vor der Bestellung kontaktieren?
Ja. Bioinformatik-Projekte variieren stark, daher ist es besser, deinen Datentyp, das Design und die erwarteten Ergebnisse vor Beginn zu überprüfen.
