Ich führe Massen-RNAseq-Analyse mit differentieller Genexpression, GO- und Pfadanalyse durch

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Wissenschaftlicher Berater

PhD in Bioengineering. Hauptfach Molekularbiologie an der Universität, kurz mit Nanopartikeln gearbeitet, dann Gewebekultur und später Organ-on-chip. Jetzt als Onkologieforscher in einem Krankenhaus t...
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Über diesen Service

Hast du RNA-seq-Daten und brauchst klare, verteidigungsfähige Ergebnisse?

Ich führe eine vollständig reproduzierbare Bulk-RNA-seq-Pipeline in R/Python durch und liefere publikationsfertige Abbildungen mit einem Experteninterpretationsbericht, damit du direkt von Rohdaten zum nächsten Abschnitt deines Manuskripts kommst.

  • Qualitätskontrolle & Design-Check: Metadaten-Überprüfung, Replikationsvalidierung, Ausreißererkennung und PCA
  • Differenzielle Expression: Analyse mit DESeq2 oder edgeR inklusive FDR-Korrektur (BenjaminiHochberg)
  • Publikationsfertige Abbildungen: Volcano, MA, PCA, gruppierte Heatmap, Pfadway-Dot- oder Bubble-Plots
  • Funktionelle Anreicherung: GO (BP/MF/CC) ± KEGG/Reactome via g:Profiler oder clusterProfiler
  • Organisierte Daten Tabellen: normalisierte Counts, varianzstabilisierte Werte und DEG-Tabellen (CSV/XLSX)
  • Detaillierter Bericht: HTML oder PDF mit vollständigen Methoden, Parametern und verständlicher Interpretation


Was ich von dir brauche:

Option A: FASTQ-Dateien + Probenblatt

Option B: Rohzählmatrix (Gene × Proben) + Probenblatt

Mensch, Maus, Ratte oder eine andere Spezies – sag einfach Bescheid.


Bitte beachten:

Die Ergebnisse dienen ausschließlich Forschungszwecken, keine klinischen oder diagnostischen Ansprüche werden erhoben. Alle Daten werden vertraulich behandelt und nicht an Dritte weitergegeben.

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do bulk rnaseq analysis with differential gene expression, go, pathway analysis
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Technologie:

Jupyter-Notizbuch

•

RStudio

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

•

Qualitative Analyse

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Expertise:

Andere

Programmiersprache:

Python

•

R

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