Ich werde eine Bioinformatik-Analyse von Mikrobiomdaten durchführen
Biologe Statistik und Bioinformatik
Über diesen Service
Benötigst du Hilfe bei der Analyse von Mikrobiom- oder mikrobiellen Amplicon-Daten? Ich kann dir bei der Verarbeitung, Analyse und Interpretation deiner Daten mit QIIME2, DADA2, Phyloseq und R helfen.
Ich kann mit 16S rRNA- und anderen mikrobiellen Amplicon-Datensätzen arbeiten und folgende Leistungen anbieten:
- QIIME2/DADA2 Datenverarbeitung und Qualitätsbewertung
- Taxonomische Zusammensetzung und Diversitätsanalyse
- Alpha- und Beta-Diversität
- Ordination und Gemeinschaftsstrukturanalyse
- Statistische Analyse und Visualisierung
- Unterschiedliche Häufigkeiten bei Bedarf
- Abbildungen in Publikationsqualität und klare Interpretation
Du erhältst: verarbeitete Ergebnisse, statistische Ausgaben, klare Abbildungen, Interpretation der Befunde und reproduzierbare Analyse-Workflows, falls in deinem Paket enthalten.
Ich lege Wert auf die Auswahl geeigneter Methoden basierend auf deiner Forschungsfrage, deinem experimentellen Design und deiner Datenstruktur.
Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, wenn du unsicher bist, welches Paket für deine Daten geeignet ist oder wenn du einen speziellen bioinformatischen Workflow benötigst.
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Arten von Mikrobiomdaten kannst du analysieren?
Ich kann mikrobielle Amplicon-Datensätze wie 16S rRNA-Daten und andere kompatible Mikrobiom-Datensätze mit QIIME2, DADA2, Phyloseq und R analysieren. Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, wenn du einen anderen Datentyp hast.
Kannst du rohe FASTQ-Dateien analysieren?
Ja. Je nach Paket kann ich mit rohen FASTQ-Dateien arbeiten und Qualitätsbewertung sowie Verarbeitung mit QIIME2 oder DADA2 durchführen. Bitte gib Informationen zu deiner Sequenzierungsplattform, Primern und deinem experimentellen Design an.
Kannst du meine Mikrobiomdaten analysieren, wenn ich nicht weiß, welche Methode ich verwenden soll?
Ja. Ich kann deine Forschungsfrage, dein experimentelles Design, Metadaten und Datenstruktur prüfen und eine passende Analyse-Workflow empfehlen.
Werde ich den Analyse-Code erhalten?
Reproduzierbarer Code kann je nach Paket enthalten sein. Ich kann R-Skripte und relevante Analyse-Workflows bereitstellen, wenn möglich.
Kannst du Figuren in Publikationsqualität erstellen?
Ja. Je nach Paket kann ich klare und publication-ready Abbildungen für Diversität, Taxonomie, Ordination, Gemeinschaftsstruktur und andere geeignete Analysen erstellen.
Kannst du differenzielle Häufigkeiten analysieren?
Ja, wenn das experimentelle Design und die Daten es unterstützen. Die geeignete Methode hängt vom Studiendesign, der Anzahl der Proben, Metadaten und Forschungsfrage ab.

