Ich werde Bioinformatik-Datenanalyse mit Python und R durchführen

Ich bin Bioinformatiker und Python/R-Entwickler mit über 5 Jahren Erfahrung in der Verarbeitung von NGS-Datensätzen und der Entwicklung analytischer Workflows. Mitautor von 15 peer-reviewed Veröffentlichungen (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).

Services:

• NGS-Datenanalyse: WGS/WES (GATK, SNP-Priorisierung, Varianten-Calling), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker) und Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
• Bioinformatik-Skripterstellung: Maßgeschneiderte Skripte und Pipeline-Entwicklung in Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) und R (Bioconductor).
• Tools & Umgebungen: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
• Datenvisualisierung: Veröffentlichungsfertige Abbildungen mit Matplotlib, Seaborn, Plotly und ggplot2.

Liefergegenstände:

• Verarbeitete Sequenzdaten und Variantsdateien (VCF, BAM, BED, Count-Matrizen).
• Sauberer, dokumentierter Code und reproduzierbare Umgebungssetups.
• Zusammenfassende Berichte mit Abbildungen und Dateninterpretationen.

Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, um deine Datenstruktur und Projektanforderungen zu besprechen.